Durante un año la ciudad ha estado tranquila, pero de nuevo un terror robótico se ha apoderado de sus calles. Un científico intrigante, el Dr. Cossack, ha llegado a la ciudad con ocho nuevos robot metálicos más grandes y malos que cualquier cosa que el Dr. Wily podría haber soñado.  5s4k1e

Un duelo cibernético se apodera de nuevo de las calles de la ciudad, donde estallan los sonidos de metal fundido enfrentándose entre sí. Armado con la nueva Mega Buster, Mega Man deberá correr, saltar y esquivar en su camino a través de laberintos hacia la ciudadela de Siberia del Dr. Cossack.